Stiftelsens hovedformål er at drive Sorø Akademis Skole samt at varetage Stiftelsens forpligtelser som ejer af Sorø Kirke og de dertil hørende to kirkegårde. I forbindelse hermed påhviler det Stiftelsen at drive Akademihaven, Idrætsanlægget og Sorø Akademis Bibliotek m.v. at vedligeholde og bevare Stiftelsens fredede og bevaringsværdige bygninger, herunder bygninger til eller forbeholdt særlige formål. at sikre helheden af Akademihaven og de omgivende naturområder m.v. at bevare godset som en samlet ejendom og som led i det omgivende miljø og at værne om stedets særpræg og om de historiske og kulturelle minder. Stiftelsen kan for at fremme disse formål yde støtte til institutioner og foreninger m.v.