Selskabets formål er at være komplementar i K/S Skagen samt at administrere K/S Skagen og driften af selskabets ejendom. For denne ydelse er det vedtægtsmæssigt bestemt i K/S Skagen, at Skagen Komplementar ApS skal oppebære 5 % af K/S Skagens overskud før finansielle omkostninger. Endvidere er det selskabets formål at indgå finansielle aftaler og kontrakter af enhver art, dels til afdækning af K/S Skagens låneportefølje, dels i rent spekulationsøjemed.