Selskabets hovedformål er gennem drift af selskabet at drive botilbud og opholdssted for personer med medfødt og erhvervet hjerneskade samt funktionelle lidelser i henhold til Ser-viceloven § 107, stk 2 og § 66, stk 5, hvor de kan få behandling og støtte til videre udvikling. Selskabets formål er endvidere gennem drift af selskabet at behandle unge mennesker mellem 15 og 40 år. Ny Fjordbos målsætning er at give unge mennesker med funktionelle lidelser, medfødt eller erhvervet hjerneskade et højt specialiseret rehabiliteringstilbud mhp på at minimere de negative konsekvenser som en given lidelse kan skabe og gøre den unge i stand til at opnå det optimale niveau af livsudfoldelse og velbefindende i det for den enkelte mest hensigtsmæssige miljø. Det er en væsentlig målsætning i så høj grad som muligt at gøre den unge i stand til at være en selvstændig aktør i egen tilværelse og så vidt muligt integrere den unge i samfundslivet som en selvstændig borger. Selskabets formål er endvidere anden beslægtet virksomhed indenfor hjerneskadeområdet m.m.